監督機關之監督權限如下：
一、發展目標及計畫之核定。
二、規章、年度營運（業務）計畫與預算、年度執行成果及決算報告書之核定或備查。
三、財產及財務狀況之檢查。
四、營運（業務）績效之評鑑。
五、董（理）事、監事之聘任及解聘。
六、董（理）事、監事於執行業務違反法令時，得為必要之處分。
七、行政法人有違反憲法、法律、法規命令時，予以撤銷、變更、廢止、限期改善、停止執行或其他處分。
八、自有不動產處分或其設定負擔之核可。
九、其他依法律所為之監督。