預算中心設五組，分掌下列事項：
一、第一組：
（一）關於內政委員會主審之各機關施政計畫、事業計畫及其預算、決算等研究、分析、評估及諮詢事項。
（二）關於交通委員會主審之各機關施政計畫、事業計畫及其預算、決算等研究、分析、評估及諮詢事項。
二、第二組：
（一）關於外交及國防委員會主審之各機關施政計畫、事業計畫及其預算、決算等研究、分析、評估及諮詢事項。
（二）關於司法及法制委員會主審之各機關施政計畫、事業計畫及其預算、決算等研究、分析、評估及諮詢事項。
三、第三組：關於經濟委員會主審之各機關施政計畫、事業計畫及其預算、決算等研究、分析、評估及諮詢事項。
四、第四組：
（一）關於財政委員會主審之各機關施政計畫、事業計畫及其預算、決算等研究、分析、評估及諮詢事項。
（二）關於社會福利及衛生環境委員會主審之各機關施政計畫、事業計畫及其預算、決算等研究、分析、評估及諮詢事項。
五、第五組：
（一）關於教育及文化委員會主審之各機關施政計畫、事業計畫及其預算、決算等研究、分析、評估及諮詢事項。
（二）關於各國預算制度蒐集、整理、分析、評估及研究事項。

關於中央政府總預算案及中央政府總決算審核報告案之整體評估、分析事項，由各組共同辦理之。

與預算、決算有關議案及政策之研究、分析、評估及諮詢事項，由各組分別辦理之。