聲請或請求核發秘密保持命令事件，依隨到隨分方式另行分案，並由本案繫屬法院辦理。

刑事案件上訴最高法院中，而卷證已送交該法院時，最高法院辦理前項秘密保持命令事件，為認定營業秘密之內容及其範圍，而有調查事實之必要者，於敘明應調查事由後，得將該事件發由智慧財產法院裁定之。

智慧財產法院為前項裁定前，得向最高法院調取卷證。

秘密保持命令事件之卷宗封面應與其他卷宗封面區分不同顏色。