企劃經理科掌理事項如下：
一、本國家公園各項計畫之規劃、檢討及變更。
二、本處與各有關機關及單位之協調配合。
三、本國家公園區域（以下簡稱本區域）內經營管理與重大建設之規劃及研擬。
四、本區域內土地與海域使用申請案件之審核及用地取得之處理。
五、國家公園事業興設之規劃。
六、國家公園法規與管理資料之蒐集、研究及管制要點之擬訂。
七、本區域內建築物設計規範、違章建築查報及違反國家公園法案件之處理。
八、本處資訊業務。
九、未來海洋型國家公園籌設之企劃經理業務規劃。
十、其他有關企劃經理事項。