本基金之收支管理，由衛生福利部委託勞動部勞工保險局（以下簡稱勞保局）辦理。本基金之運用管理，由衛生福利部委託勞動部勞動基金運用局（以下簡稱基金運用局）辦理；必要時，經衛生福利部同意後，得將部分運用事項委託金融機構辦理。

本基金之監督事項，由衛生福利部國民年金監理會（以下簡稱監理會）辦理。