評估機構有下列情形之一者，中央主管機關得廢止其指定，並公告之：
一、評估人員、第九條第一項第二款、第三款之人員變更，未依第十五條規定辦理。
二、第九條第一項第四款、第五款應具備之設施設備不足，經中央主管機關限期令其改善，屆期未改善，且情節重大。
三、依第九條第二項指定之評估機構，其內政部營建署代辦建築物耐震能力詳細評估工作共同供應契約（簡約）經終止或解除，或認可辦理耐震能力評估檢查證明文件經註銷或廢止。
四、違反第九條第三項規定，經中央主管機關限期令其改善，屆期未改善，且情節重大。
五、由未具第十一條第一項、第三項、第四項規定資格之人員進行評估。
六、違反第十四條利益迴避規定。
七、出具不實之評估報告書。
八、以不正當方式招攬業務或未依規定收取費用，經查證屬實。
九、無正當理由，拒絕、規避或妨礙中央主管機關之檢查或勘查，或拒絕提供資料，經中央主管機關限期令其改善，屆期未改善，且情節重大。

經中央主管機關依前項規定廢止指定者，自廢止指定之日起三年內，不得重新申請指定為評估機構。