經主管機關許可之內容不得擅自變更；確有變更必要者，應依下列規定辦理：
一、僅變更申請主體者，應經目的事業主管機關同意後，送主管機關備查。
二、有下列情形之一者，應檢具變更內容對照表向主管機關申請許可：
（一）降低使用強度。
（二）減少使用面積。
（三）提升公共通行或公共水域使用之功能。
三、有下列情形之一者，應檢具差異分析報告向主管機關申請許可：
（一）變更使用類型。
（二）增加使用面積或使用強度。
（三）變更施工期限。
四、有下列情形之一者，應就申請變更部分，依第五條規定向主管機關重新申請許可：
（一）變更保障公共通行之具體作為或替代措施。
（二）變更保障公共水域使用之具體作為。
（三）加重對周邊生態環境與相關設施之影響。