執行採樣時應優先採取唾液樣本，其次為血液樣本，再其次為毛髮樣本。唾液及毛髮樣本得由法院、軍事法院、檢察官、軍事檢察官、司法警察機關執行採取，血液樣本應由醫事人員採取。

執行採樣完畢後，執行採樣機關應製作去氧核醣核酸採樣證明書發給被採樣人，並於採得之去氧核醣核酸（以下簡稱DNA）樣本記載本條例施行細則第六條規定事項。