國際組織司掌理事項如下：
一、聯合國體系各組織相關事務之觀察、研析與推動參與各該組織之規劃、協調及執行。
二、其他政府間國際組織、多邊機制之參與、觀察及研析。
三、我國參與政府間國際組織及多邊機制權益之維護。
四、其他有關政府間國際組織事項。