本基金設榮民醫療作業基金管理會（以下簡稱本會），置委員十五人，其中一人為召集人，由退輔會副主任委員兼任；其餘委員如下：
一、退輔會主任秘書、就醫保健處處長、會計處處長。
二、榮民總醫院或所屬分院院長代表七人。
三、行政院外交國防法務處、行政院主計總處、衛生福利部、財政部代表。

本會每四個月開會一次，必要時得召開臨時會議，均由召集人召集之，並得邀請有關人士列席；召集人不能出席時，由召集人指派委員一人代理。