核醫部掌理事項如下：
一、核子診療、放射製藥、保健物理、放射免疫分析、醫用核子裝備之維護、輻射防護、教學訓練及研究發展。
二、迴旋加速器運轉、放射化學與製藥、正子影像檢查與教學訓練及研究發展。
三、支援建教合作醫療院所有關核醫科之醫療及教學相關業務。
四、其他有關核醫醫療事項。