職業醫學及臨床毒物部掌理事項如下：
一、職業醫學與臨床毒物病人之疾病檢查、診斷及治療；職業傷病防治及健康促進計畫。
二、職業醫學、臨床毒物各種疾病與職業健康管理之教學、研究及訓練。
三、支援合作醫療院所有關職業醫學、臨床毒物與職業健康管理之醫療及教學相關業務。
四、其他有關職業醫學、臨床毒物及職業健康管理醫療事項。