本署設下列組、室：
一、所得稅組，分五科辦事。
二、消費稅組，分三科辦事。
三、財產稅組，分四科辦事。
四、監察組，分二科辦事。
五、稽核組，分五科辦事。
六、稽徵行政組，分六科辦事。
七、秘書室，分三科辦事。
八、人事室。
九、政風室。
十、主計室。