系統設計及資理組掌理下列事項：
一、辦公室自動化之整體資訊作業及跨域資訊交流。
二、資訊系統開發、建置及維護。
三、財政部及所屬機關（構）資訊訓練之規劃。
四、本中心應用系統測試平台使用規範與品質管理制度之訂定、推動及輔導。
五、財稅資料之收件、整理、掃描、登錄及抽核等資料處理作業。
六、受理財稅資料查調作業。
七、其他有關系統設計及資料處理事項。