貨棧業者違反第五條第四項、第十一條第一項、第十二條、第十八條第三項或第四項規定者，由海關依關稅法第八十六條規定，予以警告或處新臺幣六千元以上三萬元以下罰鍰，並得命其限期改正；屆期未改正者，按次處罰；處罰三次仍未完成改正者，得停止六個月以下進儲貨物。