同一報單內有多項申報不符（有短報、溢報、短溢報兼有或有匿報）時，計算有無逾越免罰標準之方式如下：
一、核計報運進、出口貨物及加工外銷貨物報運出口，有無虛報數量、重量或品質逾百分之五者，以單項產品計算。但進口貨物以同一貨名、同一規格、同一廠牌；出口貨物以同一類貨品、同一廠牌；加工外銷貨物以同一類貨品或材質為一計算單位時，得合併計算。
二、各項不符均未逾越原申報數量、重量百分之五者，不論其漏稅額或溢沖退稅額總數若干均免罰。
三、各項不符雖均逾原申報數量、重量，惟其中有逾百分之五者，亦有未逾百分之五者，核計漏稅額或溢沖退稅額時，未逾百分之五者不必合併核計。若總數超過新臺幣五千元應予論罰，不因某項未超過新臺幣五千元而免罰；若總數未超過新臺幣五千元，亦不因某單項超過百分之五而予以處罰。
四、各項不符中有短報或溢報超過百分之五，並有短裝或溢裝者，核計漏稅額或溢沖退稅額時，短裝或溢裝部分准予扣除；其未逾新臺幣五千元者免罰。
五、涉有虛報數量、重量之項目，並涉及品質、廠牌等不符者，因非單純虛報數量、重量，故不計算其數量、重量是否逾越百分之五，僅計算漏稅額或溢沖退稅額是否在免罰限額內。
六、同一報單內分別申報多項產品，其中部分虛報數量、重量，部分虛報貨名，部分虛報型號等之案件，僅對虛報數量、重量部分計算是否逾越百分之五，逾越百分之五者再與虛報貨名、型號等之項目合併核計漏稅額或溢沖退稅額。