本會掌理下列事項：
一、國家科學發展、技術研究與應用政策之綜合規劃、協調、審議及資源分配。
二、國家科學發展、技術研究與應用計畫之綜合規劃、協調、審議、資源分配及管理考核。
三、基礎及應用科技研究之推動。
四、重大科技研發計畫及支援學術研究之推動。
五、產業前瞻技術研發與學研新創政策之綜合規劃、協調及推動。
六、科學園區發展之規劃及推動。
七、行政院國家科學技術發展基金之管理。
八、其他有關科學發展、技術研究及應用事項。