原住民族教育研究中心掌理事項如下：
一、原住民族教育資源平臺之整合及建置。
二、原住民族教育發展相關之研究。
三、原住民族學生學習成就之調查。
四、原住民族教育政策專業諮詢之提供。
五、各國原住民族教育制度及政策之研究。
六、其他有關原住民族教育研究事項。