本中心設董事會，置董事九人至十五人，由行政院院長就下列人員遴聘之：
一、行政院國家科學委員會主任委員及有關機關首長。
二、國內、外具有卓越科學技術成就及國際聲望之學者、專家。

董事任期三年，期滿得續聘之；依前項第一款遴聘之董事人數不得超過董事總數三分之一，並依職位任免改聘；依前項第二款遴聘之董事任滿前出缺者，由行政院院長補聘之；其聘期至補滿原任者之任期為止。