本院設下列處、室：
一、綜合規劃處，分三科辦事。
二、器物處，分三科辦事。
三、書畫文獻處，分四科辦事。
四、登錄保存處，分四科辦事。
五、行銷業務處，分三科辦事。
六、展示服務處，分四科辦事。
七、南院處，分四科辦事。
八、數位資訊室，分三科辦事。
九、秘書室，分四科辦事。
十、人事室，分二科辦事。
十一、主計室，分二科辦事。
十二、政風室。