機關施以隔離保護應由機關人員填寫收容人施以隔離保護報告表，經機關長官核准後，始得為之。但緊急時，得先行實施，並立即報告機關長官。

機關施以隔離保護後，應通知衛生科安排合適之醫事人員評估收容人身心狀況。醫事人員評估後，認有不適宜繼續隔離保護者，應停止之。

機關施以隔離保護後，應以電話、視訊或其他適當方式，通知受隔離保護者之家屬或最近親屬；家屬或最近親屬有數人者，得僅通知其中一人；其不能或無法通知者，得免通知。另製作收容人施以隔離保護書（一式三聯），第一聯交由收容人本人簽收，其拒絕或無法簽收者，應記明事由；第二聯送達其指定之家屬或最近親屬，不能或無法送達者，得免送達；第三聯留機關存查。