主任工程司承局長、副局長之命，統籌督導本局水資源調度管理及水源建設工程，並審核各單位陳（判）文稿、計畫書及報告。

秘書承局長、副局長之命，負責一般行政文稿之核閱及其他交辦事項。

課長、室（管理中心）主任承局長、副局長之命，督導所屬，並綜理各該單位業務。

正工程司、副工程司、專員、工程員、課員、辦事員、書記，各承其直屬主管之命，處理其主辦之公務。