水庫（壩、堰）管理中心職掌如下：
一、水庫（壩、堰）蓄水利用、運轉及資訊系統管理事項。
二、水庫（壩、堰）防洪運轉之操作、執行及成果分析編報事項。
三、警報系統之研訂與誰護、執行，緊急狀況之處理事項。
四、水庫（壩、堰）設施之檢查維護、漂流木及浚渫之執行事項。
五、各項結構之計測、觀測或檢查維護事項。
六、水庫（壩、堰）區安全管理與環境維護事項。
七、水質檢驗及污染管制事項。
八、水庫（壩、堰）淤積之測量、調查及排除事項。
九、觀光業務之推動與執行事項。
十、其他關於集水區經營與維護事項。