本基金為預算法第四條第一項第二款所定之特種基金，編製附屬單位預算，以經濟部（以下簡稱本部）為管理機關；其下分別依科技產業園區設置管理條例及產業創新條例之規定，設置科技產業園區作業基金及產業園區開發管理基金二個基金，編製附屬單位預算之分預算。