中央主管機關對依本辦法規定申請之案件，除進行書面審查外，並得派員或委託專業機構實地查勘。

中央主管機關必要時，得請生質燃料業者及再生油品業者報告其業務，並得派員或委託專業機構查核其實際營業相關資料，業者不得妨礙、拒絕或規避。

中央主管機關得請生質燃料業者報告其摻配業務經營情形，或報告其摻配酒精汽油、生質柴油之流向，並得派員或委託專業機構予以查核，業者不得妨礙、拒絕或規避。