企業符合本辦法第三條所訂受損企業認定資格者，得依前條規定，檢具相關證明文件，向主管機關所設立之單一服務窗口提出受損企業認定申請。

前項企業申請案件經受理，並確認其申請資格後，應將申請案轉送中央目的事業主管機關，依本辦法第四條規定辦理企業因市場開放受影響達一定程度之認定。

中央目的事業主管機關為辦理前項認定，應邀集主管機關、相關產業公協會、學者專家及其他相關機關召開會議審議，再將認定結果通知申請企業。