離島自來水營運單位或自來水合作社於各年度結束後，應編列決算書，提報上一年度售水虧損額度，向中央自來水主管機關申請撥補；中央自來水主管機關應於接獲申請後三個月內完成初審，核撥虧損額度七成之經費。其虧損餘額之撥補，按經審計部審定或會計師簽證後之財務報表，於一個月內依上一年度之售水虧損實績編製報表，向中央自來水主管機關申請撥補；中央自來水主管機關應於接獲申請後三個月內完成審核，並覈實撥補其餘額。