管理科掌理事項如下：
一、轄管據點之經營與管理及對外交通之協調聯繫。
二、觀光資源與特定生態、地質、景觀及水域資源之維護。
三、國家風景區管理業務與管理站之聯繫及協調。
四、轄管據點旅遊秩序、環境清潔、旅遊安全之維護及管理。
五、轄管據點違反各項法規事件之處理。
六、駐衛警察隊之聯繫及協調。
七、其他有關管理事項。