工程科掌理事項如下：
一、公路工程採購案件之處理。
二、公路整建工程施工之審核、管制及考核。
三、公路整建工程品質稽查計畫之擬訂、執行、驗收及移交。
四、公路工程計畫年度預算之執行及管控。
五、公路建築工程施工之審核、管制及考核。
六、公路工程相關教育訓練作業之辦理。
七、公路工程爭議之調解、仲裁或訴訟業務之處理。
八、其他有關工程事項。