秘書室得分科辦事，掌左列事項：
一、文稿復閱及陳轉事項。
二、機要文電之收發、撰擬及保管事項。
三、重要工作報告之撰擬及彙報事項。
四、部務會報之準備、紀錄、整理及分行事項。
五、行政革新、業務改進之研究、推動及督導事項。
六、年度施政方針、施政計畫、施政成果及重要措施之彙報事項。
七、為民服務工作之推動、督導及考核事項。
八、本部所屬機構管制考核業務推動督導事項。
九、本部及所屬機構重要施政（業務）項目與交辦案件追蹤管制事項。
十、本部及所屬機關年度業務檢討與工作考成事項。
十一、公文處理時效之檢查、管制及稽催事項。
十二、公文處理簡化革新之研議事項。
十三、研究發展、管制考核、公文處理統計及資料收集彙報事項。
十四、本部及所屬機構研考業務績效之審議事項。
十五、本部分層負責及部屬機構代辦部稿之研訂事項。
十六、本部公報編輯事項。
十七、民意機構質詢、查詢、建議案件之分辦、彙復及協調聯繫事項。
十八、監察院調查，糾彈案件之分辦及追蹤考核事項。
十九、交通以外單位或外賓考察、訪問、參觀交通設施之安排及接待事項。
二十、新聞發布、協調及聯繫事項。
參事室掌左列事項：
一、業務性法規之會核事項。
二、有關法案及命令文稿之會核事項。
三、計畫方案之會核事項。
四、公約及契約之會核事項。
五、訴訟與陳訴案件之審核及擬議事項
六、公民營交通事業核准立案之會核事項。
七、業務之研究改進及重要政務之建議事項。
八、部次長交辦事項。
技監室掌左列事項：
一、交通各業重要技術案件之規劃及審議事項。
二、交通技術標準規範之審定及頒布事項。
三、本部暨所屬機關捐助之財團法人業務監督事項。
四、部次長交辦事項。
路政司得分科辦事，掌左列事項：
一、全國鐵路與公路系統之規劃及審定事項。
二、鐵路與公路機構組織之審議事項。
三、鐵路與公路營運業務之監督及考核事項。
四、鐵路與公路重要建設工程之審核及督導事項。
五、鐵路與公路客、貨運價之審核事項。
六、鐵路與公路器材之採購、保管、支配、轉運、檢驗、監製之稽核及審議事項。
七、出席國際鐵路與公路會議及考察、研習案件之審核事項。
八、鐵路與公路從業人員訓練計畫之審議及考核事項。
九、鐵路與公路行車安全案件之審核及督導事項。
十、地方營、民營與專用鐵路業務之監督及考核事項。
十一、公路監理業務之督導及考核事項。
十二、路政法規及國際約章之擬議事項。
十三、公路經營與公路運輸案件之督導及考核事項。
十四、汽車燃料使用費徵收之督導及考核事項。
十五、公路工程受益費案件之審議事項。
十六、國內汽車製造業出產汽車及國外進口汽車規格案件之審查事項。
十七、都市計畫案件之會辦事項。
十八、觀光地區之規劃、開發、整建、管理之督導及考核事項。
十九、國際觀光旅館、觀光旅館興建、管理之督導及考核事項。
二十、旅行業與導遊人員管理之督導及考核事項。
郵電司得分科辦事，掌理下列事項：
一、郵政事業發展政策之規劃及督導。
二、郵務、集郵與資產營運業務之督導及管理。
三、郵政儲金匯兌、簡易人壽保險與郵政資金運用業務之督導及管理。
四、郵政相關法規及國際約章之擬議。
五、郵政重要工程之審核及督導。
六、郵政工作計畫及工作報告之審核。
七、郵政監理及訴訟業務之執行。
八、郵政轉投資事業之督導、管理及協調。
九、郵政相關兩岸或國際會議、活動與交流之策略規劃及參與。
十、其他有關郵政事項。
航政司得分科辦事，掌左列事項：
一、航業、民用航空、港務及氣象發展計畫之核議事項。
二、公有及民營航業、民用航空、港務與氣象之監督事項。
三、航業及民用航空運輸航線與費率之核議事項。
四、航業經營及聯營之規劃與策進事項。
五、航業、民用航空、港務、氣象法規及國際約章之擬議事項。
六、各種航政技術人員執業證書核發之監督事項。
七、航舶購建、檢查、丈量、登記及證書核發之監督事項。
八、驗船機構之管理、監督事項。
九、打撈業之管理、監督事項。
十、國際商港、民用航空場、站及氣象測站設置之審核事項。
十一、碼頭、倉庫、港埠工程及航空建設工程之核議監督事項。
十二、船員及引水人儲訓之監督事項。
十三、船舶航行安全、維護、管制、海難救護及海事審議事項。
十四、國際航業海事、港務、民用航空、氣象組織及會議案件之處理事項。
十五、航政工作計畫及工作報告之審核事項。
十六、航政預算、決算及財務案件之會核事項。
十七、航業及民用航空資金籌措與貸款審核處理事項。
十八、其他有關航業、民用航空、港務及氣象事項。
總務司得分科辦事，掌左列事項：
一、公文之收發、分辦、繕校及保管事項。
二、印信典守事項。
三、本部所屬機構印信之頒發、換發及舊印信之繳銷事項。
四、本部經費、歲入款及有價證券之出納、保管、登記事項。
五、各項專款之出納及保管事項。
六、外匯之結購事項。
七、本部所屬機關款項之代領及轉發事項。
八、本部各種合約之保管事項。
九、本部財產物品之購置、保管、供應、登記及處理事項。
十、各種會場之佈置、辦公處所之管理及環境衛生之整理事項。
十一、公務車輛之管理、維護、保養及油料購發事項。
十二、本部員工實物配給之請領及分發事項。
十三、本部技工、工友及警衛之管理事項。
十四、本部出版書刊之印刷、發行及保管事項。
十五、本部及所屬機構土地徵收、撥用、交換與受贈事項。
十六、本部所屬機構房地產購置、標售及租借之監督事項。
十七、本部房地產之購置、標售、租借、營繕、產權登記及所有權狀之保管事項。
十八、本部財產之異動登記及保管事項。
十九、本部及所屬機構公教住宅之改建與審議事項。
二十、本部辦公處所及員工宿舍房屋、水電之修繕、維護、分配與管理事項。
人事處得置幫辦一人，由本部高級人員派兼，襄助處長處理業務。
人事處得分科辦事，掌左列事項：
一、交通人事制度之規劃及改進事項。
二、人事法規之擬議事項。
三、本部及所屬各機關組織法規編制員額之擬訂、審核事項。
四、本部及所屬機構人員之派免、遷調、退休與撫卹事項。
五、本部及所屬各機關人員之考績（成）、考核、獎懲、勤惰與差假事項。
六、本部暨所屬各機關職位分類事項。
七、本部暨所屬機構考試分發事項。
八、本部暨所屬各機關員工待遇、獎金、保險、福利及福利康樂事項。
九、本部暨所屬機構員工訓練、進修與觀摩、考察事項。
十、交通人才調查、儲備、人力動員及運用事項。
十一、本部暨所屬機構人事查核事項。
十二、本部及所屬機構公務機密維護與洩密案件查處項。
十三、本部及所屬機構實體安全與員工心理安全之防護事項。
十四、本部及所屬機構端正政風、整肅貪污案件之查處事項。
十五、本部及所屬機構員工之保防教育事項。
十六、交通人員出入境及護照之核轉事項。
十七、本部及所屬機構人事單位與人事人員之管理事項。
十八、本部及所屬機構員工兵役事項。
十九、人事資料之調查、統計、登記、管理與表報事項。
二十、其他有關人事事項。
會計處得分科辦理，掌左列事項：
一、本部及所屬機構年度預算決算之籌劃、審議與編報事項。
二、本部及所屬機構與公民營交通事業機關中長程發展計畫之評估、會核與擬辦事項。
三、本部及所屬機構與公民營交通事業機關會計制度，財產物料管理制度之擬辦、修訂與核議事項。
四、本部及所屬機構與公民營交通事業機關收費率之會核，財務收支，損益盈虧、經營績效之評估、會核與擬辦事項。
五、本部及所屬機構與公民營交通事業機關涉及營業稅、所得稅關稅等有關財稅獎勵減免案件之擬議，核辦及會核事項。
六、本部及所屬機構預算執行之控制、財務收支之檢查、舉借債款之核議、各項債權債務之督導清理與現金、票據、證券、銀行存款之抽點、複核事項。
七、本部及所屬機構營繕工程購置、定製、變賣財物之核議、監辦與財產壽年之評估、財產汰舊換新、報發、質押、交換、贈與、保險之擬議核辦事項。
八、本部及所屬機構各項會計事務處理之規劃、督導與管理事項。
九、本部及所屬機構績效報告之審核、彙編事項。
十、本部及所屬機構外匯收支預算之審核、編報與結購外匯之審查、核辦事項。
十一、本部及所屬機構會計機構之設置、會計人員之任免、遷調考核、獎懲、進修、訓練、退休、資遣等有關會計人事案件之擬議與核辦事項。
十二、有關財務、稅務、預算、會計法規案件之擬議及核辦事項。
十三、其他有關預算會計事項。
統計處得分科辦事，掌左列事項：
一、有關通信、運輸及倉儲等之基本國勢調查事項。
二、分析、提供經濟建設計畫及國防動員之所需統計調查事項。
三、提供國家統計總報告有關交通統計資料之蒐集、審核及統一報表程式之擬議事項。
四、編製提供國民所得及總供需估測所需之統計事項。
五、彙編中華民國交通統計要覽、月報、交通各業營運實績及交通事故之統計事項。
六、交通事業統計圖表、幻燈、影片、錄音之設計及製作事項。
七、國際交通統計資料之蒐集、編譯、研究及交換事項。
八、本部及所屬機構統計業務之規劃督導及管理事項。
九、本部統計人員之任免、遷調、考核、獎懲、進修、訓練、退休、資遣等有關統計人事案件之擬議及核辦事項。
十、交通事業統計制度之研究、設計、審核及修訂事項。
十一、統計法規之擬議事項。
十二、其他有關統計事項。
法規委員會掌左列事項：
一、交通法規之修訂、編纂及解釋事項。
二、有關法律案件之審議事項。
三、業務行政涉及法律之審議事項。
四、法規、公約之蒐集、分析及研究事項。
五、法規動態之登記、統計及管制事項。
六、年度立法計畫之研議事項。
七、立法院審查有關本部法案之列席事項。
八、出席各種法規審查、研究會議事項。
九、本部及所屬機構績效報告之審核、彙編事項。
訴願審議委員會掌左列事項：
一、訴願案件之處理事項。
二、訴願案件之調查及審議事項。
三、訴願案件之決定事項。