局長綜理局務，並指揮監督所屬員工；副局長襄理局務；主任秘書，襄助局長、副局長處理局務。

港務長，綜理港務事項；總工程司，綜理工務事項；副總工程司襄助總工程司處理相關業務。

組室主管承局長、副局長之命，處理本單位事務，科長承本單位主管之命，處理業務。

其餘各級人員，各承長官之命，辦理應辦事項。