船舶編管主管機關、編管執行機關及需求運用機關如下：
一、船舶編管主管機關：交通部。
二、商用船舶及其船員編管執行機關：交通部航港局。
三、漁船及其船員編管執行機關：行政院農業委員會漁業署及直轄市、縣（市）政府。
四、軍事需求運用機關：國防部及所屬軍事機關。
五、行政需求運用機關：中央各機關、直轄市及縣（市）政府。

前項第一款業務交通部得委任交通部航港局辦理。