二等航行員指在下列船舶服務之艙面部門甲級船員：
一、在總噸位五百以上未滿三千航行於國際航線之船舶。
二、在總噸位五百以上未滿一萬航行於兩岸直航之船舶。
三、在總噸位五百以上未滿一萬航行於國內航線之船舶。

船舶具下列情形之一者，得配置二等航行員：
一、在總噸位三千以上未滿八千且航行於東經九十度以東，一百五十度以西，南緯十度以北及北緯四十五度以南近海區域之船舶。
二、在總噸位一萬以上航行於兩岸直航之非客船。
三、在總噸位一萬以上航行於國內航線之非客船。

第一項第一款及第二項第一款規定，自中華民國一百十二年七月一日起停止適用。但停止適用前領有二等航行員適任證書者，不在此限。