臺灣地區民用航空運輸業申請飛航兩岸定期航線，其航線籌辦、航機務審查、試航、航線證書申請、繳還、註銷或換發、航線暫停、終止或復航、定期飛航班機時間表報核、證書費及其有效期限等事項，準用民用航空運輸業管理規則第十二條、第十三條第一項、第十三條之一第三項至第七項、第十五條第一項、第三項、第十九條第一項及第三十五條規定。

臺灣地區民用航空運輸業應將前項定期航線之客、貨運價，報請交通部民用航空局（以下簡稱民航局）轉報交通部備查，變更時，亦同。客、貨運價之使用限制、報請備查程序及生效日期等事項，準用航空客貨運價管理辦法第二條、第三條、第十條及第十一條有關國際定期航線規定。