口腔健康司掌理事項如下：
一、口腔健康政策之規劃、推動及相關法規之研訂。
二、口腔衛生教育及預防保健之規劃及推動。
三、口腔醫療服務體系之規劃、發展及管理。
四、口腔衛生醫事人員管理與人力發展政策之規劃、推動及相關法規之研訂。
五、口腔醫事機構管理政策之規劃、推動及相關法規之研擬。
六、口腔醫療品質與病人安全之管理及醫療爭議之處理。
七、口腔醫療科技與國際發展之規劃及推動。
八、其他有關口腔健康事項。