本部設下列司、處：
一、綜合規劃司，分八科辦事。
二、社會保險司，分七科辦事。
三、社會救助及社工司，分四科辦事。
四、護理及健康照護司，分三科辦事。
五、保護服務司，分五科辦事。
六、醫事司，分六科辦事。
七、心理健康司，分五科辦事。
八、中醫藥司，分四科辦事。
九、長期照顧司，分四科辦事。
十、口腔健康司，分三科辦事。
十一、秘書處，分五科辦事。
十二、人事處，分四科辦事。
十三、政風處，分二科辦事。
十四、會計處，分六科辦事。
十五、統計處，分四科辦事。
十六、資訊處，分四科辦事。