醫療廢棄物清除處理設施有下列情形之一，經直轄市或縣（市）衛生主管機關通知限期完成改善，屆期未改善或未完成者，直轄市或縣（市）衛生主管機關得終止輔導：
一、喪失從事業務能力或一年內無從事醫療廢棄物清除、處理業務者。
二、違反本法或本辦法規定，經主管機關裁罰確定後，並經衛生主管機關認定情節重大者。

醫療廢棄物清除處理設施經通知終止輔導者，自書面通知送達之日起，喪失受直轄市或縣（市）衛生主管機關輔導之資格，不得再依本辦法接受委託清除、處理醫療廢棄物。