醫院設立或擴充、減少一般病床數時，應向直轄市、縣（市）主管機關申請；其程序如下：
一、公立醫院、私立醫院或法人附設醫院：
（一）設立或擴充、減少後之一般病床數在九十九床以下：由直轄市、縣（市）主管機關許可。
（二）設立或擴充、減少後之一般病床數達一百床以上：由直轄市、縣（市）主管機關擬具意見，報中央主管機關許可。
（三）第十四條國際醫療病床數之設立或擴充、減少：由直轄市、縣（市）主管機關擬具意見，報中央主管機關許可。
二、醫療法人設立之醫院：由直轄市、縣（市）主管機關擬具意見，報中央主管機關許可。

醫院擴充總樓地板面積，不涉及增減一般病床者，應向直轄市、縣（市）主管機關申請許可。