各分所掌理下列事項：
一、特定畜禽產業之品種改良、生理、遺傳資源保存及利用之研究。
二、特定畜禽產業之營養、飼料資源開發及生產技術之研究。
三、特定畜禽產業飼養管理技術、省工及智慧化生產模式之研究。
四、特定畜禽產業之廢棄物處理、資源永續利用及淨零碳排之研究。
五、特定畜禽產品加工製造技術之研究。
六、地區性畜禽產業技術輔導及推廣之執行。
七、其他有關畜產試驗研究及輔導推廣事項。