作物改良課掌理下列事項：
一、農作物育種與新品種示範及優良種苗繁殖。
二、農作物栽培管理技術、應用生物技術、採後處理與加工技術之研發、示範及推廣。
三、優質安全農作物產品生產技術與體系之研發、示範及推廣。
四、農作物天然災害之防範與復育技術之研發及推廣。
五、植物與微生物遺傳資源蒐集、保存及應用。
六、植物組織培養技術之研發、應用及輔導。
七、分子標誌技術之研發、應用與植物品種及物種鑑定服務。
八、基因改造植物檢測技術之研發及服務。
九、其他有關農作物改良事項。