本場設下列科、室、分場：
一、作物改良科。
二、作物環境科。
三、農業推廣科。
四、秘書室。
五、人事室。
六、主計室。
七、斗南分場。
八、鹿草分場。
九、朴子分場。
十、義竹分場。