遺傳育種系掌理事項如下：
一、花卉種原之蒐集、鑑定、保存、評估及開發利用。
二、花卉育種技術開發及應用之研究。
三、花卉遺傳分析、生物技術及品種改良之研究。
四、其他有關花卉遺傳育種試驗研究事項。