產業應用系掌理事項如下：
一、花卉產業資訊蒐集、分析及利用之研究。
二、景觀綠美化技術開發及應用之研究。
三、花卉產品開發及加值利用之研究。
四、花卉產業經營管理技術之研究。
五、花卉綠色照護技術開發及產業應用之研究。
六、其他有關花卉產業應用試驗研究事項。