疾病診斷組掌理事項如下：
一、禽類疾病、草食動物疾病、人畜共通傳染病之檢診、調查、監測、致病機轉與防治技術之研究及改良。
二、禽類疾病、草食動物疾病、人畜共通傳染病檢驗方法之訂定及檢診所需資材之建置。
三、所管實驗室診斷檢驗能力比對作業、品質保證規範之規劃、建置及執行。
四、獸醫流行病學之研究。
五、獸醫病理學之診斷服務。
六、獸醫科技推廣與教育訓練、獸醫科技計畫之管理、創新育成、產學合作、技術移轉及研發成果管理。
七、國際事務之聯繫、協辦及活動紀錄。
八、其他有關陸生動物疾病事項。