乳牛科技系掌理事項如下：
一、乳牛育種、生理、遺傳資源保存及利用之研究。
二、乳牛營養、飼料資源開發及生產技術之研究。
三、乳牛飼養管理技術、省工及智慧化生產模式之研究。
四、乳牛廢棄物處理、資源永續利用及淨零碳排之研究。
五、提升生乳品質及檢驗技術之研究。
六、其他有關乳牛科技研究事項。