農產品平準基金有左列情形之一者，主管機關或受委託管理機關得報請行政院核定後裁撤之。
一、未經主管機關指定者。
二、設置期限屆滿者。
三、設置目的已完成者。
四、經主管機關或受委託管理機關認定已無存在必要者。
五、原申請設置機關請求裁撤，經主管機關同意者。
六、違反農產品平準基金管理運用準則第九條規定，情節重大者。

農產品平準基金經裁撤後，其財產與權益之歸屬，除其收支保管及運用辦法或章程有規定者外，應由主管機關或受委託管理機關報請行政院核定之。