主管機關查驗肥料，應注意下列事項：
一、肥料未列入標準檢驗主管機關應施檢驗品目者，應加強其品質抽驗。
二、製造、輸入之有機質肥料及微生物肥料，應加強其製造、加工、包裝及倉儲場所之檢查。
三、由工廠直接運至農地施用之堆肥，應至堆肥工廠（場）加強品質抽驗。
四、有機質肥料及微生物肥料之有害成分應加強抽驗。抽驗之範圍不以肥料種類品目及規格所列之有害成分為限。
五、肥料廣告檢查範圍，包括電視、書報刊、雜誌、傳單、海報、看板及網路等廣告媒體。