經主管機關、漁業合作國或國際漁業組織指派觀察員隨船者，該漁船經營者應辦理下列事項：
一、於漁船預定進港或出港七個工作日前，以書面通知主管機關。
二、依主管機關通知之時間及地點，接載觀察員上船或送返港口。
三、提供觀察員相當於幹部船員之生活照顧，包括膳食、住宿、衛生設備及醫療。
四、指示船長及船員，應配合及協助觀察員執行任務所需之相關事項。

經主管機關、漁業合作國或國際漁業組織指派觀察員隨船者，該漁船船長應遵行下列事項：
一、參加主管機關辦理之航前講習。
二、向觀察員說明漁船之作息方式、安全維護及漁船設施。
三、應配合及協助觀察員執行任務，就有關觀察任務事項所為之詢問，不得規避、妨礙或拒絕。
四、不得干擾、威脅或行賄觀察員。
五、提供觀察員船上生活與執行任務所需之空間、設備及資料。
六、要求船員應遵守前三款規定。
七、簽署觀察員作成之紀錄；對紀錄內容有不同意見時，得註記其意見。
八、確保觀察員安全；漁船遇有緊急危難時，應予特別照護及給予避難協助。

主管機關派員登船檢查時，漁船船長及船員應配合並協助檢查人員登船、離船，及提供船上生活與執行任務所需之空間及設備。