保險費之補助由主管機關於年度編列預算補助，其補助作業程序如下：
一、承保保險人受理申請補助，應於主管機關公告受理期間結束後十五日內，將申請案彙整造冊送保險人所在地之直轄市或縣（市）政府核轉主管機關審核。
二、經審核符合規定者，主管機關應於清冊送達翌日起三個月內交由財團法人農業保險基金（以下簡稱農險基金）核撥保險人。