會計科目分類如下：
一、資產、負債、淨值類：適用於各類事業。
二、事業損益類：適用於經濟事業、金融事業。
三、經費所入所出類：適用於保險事業、農業推廣事業（含輔導、訓練、文化、福利業務）。

農會會計科目採二級分類三級編號，其三級編號第一級為「大類」，第二級為「中類」，第三級為「總分類帳會計科目」。

前項所定三級編號之科目與用人費用明細子目之分類編號及名稱，不得任意變更。但為業務擴充需要，得專案報請中央主管機關核准增減之。

會計科目名稱統一規定如下：
一、資產、負債、淨值之總分類帳會計科目如附表一。
二、經濟事業收入及支出之總分類帳會計科目如附表二。
三、金融事業收入及支出之總分類帳會計科目如附表三。
四、保險事業所入及所出之總分類帳會計科目如附表四。
五、農業推廣事業所入及所出之總分類帳會計科目如附表五。
六、事業損益類費用支出之明細分類帳會計子目如附表六。
七、經費所入所出類所出之明細分類帳會計子目如附表七，會計細目如附表八。
八、資產負債之明細分類帳會計子目、會計細目如附表九。